Полное исследование гена CFTR (включая делецию 2,3, экзона) методом NGS в крови в Балашихе

Гомозиготный патогенный или условно патогенный вариант гена CFTR подтверждает диагноз CFTR-ассоциированного заболевания. При обнаружении двух гетерозиготных аберраций гена CFTR рекомендуется обследование родителей для подтверждение локализации вариантов на разных хромосомах. Обнаружение двух гетерозиготных вариантов на разных хромосомах (в транс позиции) также подтверждает CFTR-ассоциированное состояние. Описано около 2000 патогенных аберраций в гене CFTR. Ген CFTR кодирует трансмембранный регулятор проводимости муковисцидоза. Данный белок представляет собой ионный канал, участвующий в транспорте ионов хлора. В зависимости от влияния патогенных аберраций на активность белка различают 6 классов генетических нарушений: класс I - нарушение синтеза белка; класс II - нарушение созревания белка; класс III - нарушение регуляции хлорного канала; класс IV - нарушение проводимости хлорного канала; класс V - снижение количества функционального белка; класс VI - снижение времени нахождения белка на поверхности клетки. Аберрации I-III классов вызывают практически полное снижение функции белка, тогда как при аберрациях IV или V классов наблюдается остаточная функция канала. Заболевания, связанные с геном CFTR, имеют аутосомно-рецессивный тип наследования, то есть для их развития требуется наличие либо гомозиготной, либо двух гетерозиготных мутаций, находящихся на разных хромосомах. В группу CFTR-ассоциированных заболеваний входят муковисцидоз, двухсторонняя врожденная аплазия семявыносящих путей, наследственный CFTR-ассоциированный панкреатит, CFTR-ассоциированные диссеминированные бронхоэктазы, CFTR-ассоциированный синусит, синдром псевдо-Барттера. Муковисцидоз представляет собой наследственную системную экзокринопатию с аутосомно-рецессивным типом наследования, характеризующаяся поражением органов дыхания, поджелудочной железы, кишечника, печени и репродуктивной системы у мужчин. Чаще всего при муковисцидозе встречаются мутации I-III классов, которые полностью нарушают функцию ионного канала. Выявление более «легких» аберраций предсказывает более доброкачественное течение заболевания. Также, наличие некоторых мутаций может предсказывать фенотип CFTR-ассоциированных диссеминированных бронхоэктазов. Двухсторонняя врожденная аплазия семявыносящих путей является одной из основных наследственных причин бесплодия у мужчин с распространенностью 1:1000. Для данного состояния характерна обструктивная азооспермия, которая и вызывает бесплодие у мужчин. Чаще всего при этом данном заболевании обнаруживается 1 «тяжелая» мутация классов I-III (например F508del) и 1 «легкая» мутация классов IV-V или же 2 «легкие» мутации классов IV-V. Наиболее частыми мутациями в европейской популяции, которые вызывают двухстороннюю врожденную аплазию семявыносящих путей, являются F508del, а также IVS8-5T и R117H. Выявление 1 и более аберраций в гене CFTR позволяет подтвердить данное заболевание. У пациентов с «легкими» мутациями в гене CFTR может развиваться рецидивирующий (или хронический) панкреатит. Метод NGS (Next Generation Sequencing, секвенирование нового поколения) основан на массовом параллельном секвенировании специальным образом подготовленных однонитевых библиотек фрагментированной ДНК исследуемых образцов.